石英毛细管具有一系列的特性，是诸如气相色谱仪、毛细管电泳仪及毛细管液相色谱仪的必备材料之一 。它也是新近商品化的微流体仪器的关键部件。石英玻璃毛细管的各段之间或各批次之间在内径上的准确性或精确性是没有其它材料器件能够与其相媲美的。
随着各种技术的不断微型化，石英玻璃毛细管将扮演越来越重要的角色。新型微流体器件与现有常量样品处理平台之间的接口连接就是一个很好的例子 。另一个较贴切的例子是微型化的毛细管液相色谱（即纳米液相色谱）的进样阀 、色谱柱及检测器之间的连接管。
